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HOME > 콩정보센터 > 콩 정보 및 자료 > 콩 연구자료| 유전체 재분석을 통한 콩 우량 유전자의 변이 탐색 시스템 구축 (정순천 2015) By 문갑순 / 2018-07-23 AM 12:21 / 조회 : 445회 |
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유전체 재분석을 통한 콩 우량 유전자의 변이 탐색 시스템 구축 Establishment of a system to detect variation in agronomically important soybean genes by genome resequencing analysis 주관연구기관 : 한국생명공학연구 연구책임자 : 정순천 발행년월 : 2015-02 주관부처 : 농촌진흥청 원문 연구개발 결과 1. 한반도 유래 야생콩 및 우량 재배콩 16건의 유전체 재분석 결과를 생산하였다. 2. High-quality의 3.8 백만점의 SNP 및 0.5 백만점의 indel을 동정하여 이들 변이를 이용하여 다양한 집단유전적 분석을 수행하여 206개의 candidate domestication regions을 예측하였다. 3. 본 연구 결과는 2014년 4월 DNA Research (IF 5.00)의 게재하였다. 4. 2014년 추가적인 17건을 첨가하여 분석을 재수행하였다. 5. 지중해 원산인 M. truncatula를 UC-Davis의 Cook 교수팀과 국제협력을 통하여 고염토양에 적응/자 생하는 40개의 유전형을 획득하였으며 평균 28X coverage로 NGS 기술을 이용한 재분석을 실시하였다. 6. 이를 바탕으로 집단유전학적인 분석을 수행하였으며 phylogeny 분석, 집단구조 분석, 교차이식 생리 분석, LD 분석, Tajimas’ D 분석, ROD 분석 등을 완료하였으며, 이를 통하여 염해적응과 유의하다고 판단되는 다수의 유전체 지역을 동정하였으며 내재해성에 관련된 중심 유전자 발굴 작업을 수행하였다. 7. 환경스트레스 반응 / 내재해성 유전자를 비교유전체적 접근 방식으로 발굴하고 이를 분자마커로 개발하였다. |
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