한국콩연구회

고품질 기능선 콩품종 육성을 위한 분자 마커 개발

Development of molecular markers for the selection of soybean lines containing high levels of natural products for human and animal health

사업명 : 농업생명공학기술개발

주관연구기관 : 한국생명공학연구원

연구책임자 : 정순천

발행년월 : 2008-02

주관부처 : 농촌진흥청

원문

http://www.ndsl.kr/ndsl/commons/util/ndslOriginalView.do?dbt=TRKO&cn=TRKO201100015813&rn=&url=&pageCode=PG18

초록

Most of wild soybean seeds contain higher levels of natural products derived from the phenylpropanoid pathway such as proanthocyanidins, anthocyanins, and isoflavones. The final goal of this project was to develop molecular markers for the establishment of a reliable marker-assisted selection system for the development of new soybean cultivars containing various combinations of anthocyanin and isoflavone levels.

A core genetic linkage map of the soybean, in which sequence- based genetic markers are evenly distributed genomewide, was constructed from an F 12 population composed of 113 recombinant inbred lines. Although the soybean genetic linkage map is one of the most densely populated maps among plants constructed thus far, this is the first genetic map harboring 20 well-resolved lingage groups (LGs) presumed to correspond to the 20 pairs of soybean chromosomes identified from a single population. The addition of 112 novel sequence-based markers proved essential for the filling of the gaps observed in the framework map constructed using the public sequence- based markers, and also necessary for the extension of the ends of the LGs. The current genetic map allowed us to evaluate the soybean integrated maps obtained from combinations of data obtained from several mapping populations and, in addition, to detect segregation distortion regions within the whole genome. Taken together, the results will facilitate the further discovery of agronomically relevant genetic loci and map-based cloning, and should also provide some important links between the soybean LGs, physical map, and genome sequence map for future studies.

o 콩 전사체 유전지도 작성 및 고품질 기능성 QTLs 발굴

- 게놈 수준의 콩 고밀도 유전 지도의 작성 (linkage mapping)

- 콩 종자내 기능성 물질의 profiling 및 정성 정량 분석

- 기능성 물질 대사 및 조절에 관여하는 QTLs의 발굴

- 기능성 물질 대사 및 조절에 관여하는 유전자들의 cSNP 표지 제작 및 mapping

- Comparative genomics를 이용한 cSNP표지의 개발을 통한 QTLs의 targeted fine mappmg

o 기능성 물질 대사 및 조절에 관여하는 유전자들의 DB 구축 및 기능성 QTLs 연관 유전자의 기능 분석

- 기능성 물질 생합성 관련 유전자 DB 구축

- 기능성 물질 생합성 관련 QTL 연관 유전자 기능 해명

o 콩 전이인자 이용 초고속 분자표지 개발 및 고기능성 선발체계 구축

- Transposon 표지 개발 및 mapping을 통한 초고속 background selection 체계 개발

- cSNP 및 transposon 분자표지 이용 linkage disequilibrium mapping

- Linkage mapping-linkage disequilibrium mapping 유래 QTL의 분자육종 시스템 개발 (고기능성 계통 개발)